１９４２年（昭和１７年）６月２６日内地では、日本基督教団　第６部日本聖教会、第９部きよめ教会は治安維持法違反（神宮に対する不敬、天皇に対する不敬、国体変革を企図せる罪）という罪状で一斉検挙を受けた。１３０名以上の教職が検挙され、聖教会では５名の方が殉教された。 （昭和１７年　年会　写真　２７）

　１９４３年（昭和１８年）４月１日、教団部制を廃止。４月７日、ホーリネス系全教会に「宗教結社禁止令」が伝達された。
　なお昭和２０年１０月１３日「治安維持法」の廃止により、起訴された教職等は免訴となる。
　戦後、実際に内地で弾圧を受けられたご家族のお証しを聞いた。昨日まで友人であった同じキリスト教徒、牧師たちが、ホーリネス教会の牧師と同じように弾圧されることを恐れて、一切の交わりを断ったことを聞いた。殉教された高名な牧師先生のお葬式にさえ、家族以外の者はだれも出席しなかったそうである。

　１９４２年（昭和１７年）６月２６日弾圧。当時の様子は、『目で見るホーリネス・バンド』（ホーリネスバンドの軌跡刊行委員会）に薄々講義所の写真などとともに収録されている。 また『ホーリネス・バンドの軌跡』（ホーリネス・バンド昭和キリスト教弾圧史刊行会）に諸先生方とともに小池章三牧師の証言も「弾圧下における台湾の状況」と題して掲載されているが、手記にはあまり記述がない。

弾圧については、
　１９４３年（昭和１８年）４月７日、台中方面の家庭集会に出かけていたが、「早く帰れ」という心の声に従って夜１０時に帰宅した。
　「ただいま」と言って上着を脱いだとたん、玄関の戸が開き、７人程の特高警察が入ってきた。なべ、かま、米びつ、衣類以外の物には全て封印をしていった。
　４月８日。早朝、大きなトラックがやって来て、教会内の封印された物を全て持ち去った。時計、提灯、太鼓、書類、書籍、手紙、机、イス、座布団、講壇。教会の中に何も残らなかった。「夕方７時に、花蓮港警察に出頭するように」と言い渡された。父は二度と帰宅できないことを覚悟し、新しい肌着に着替え警察に出頭した。
　　　１.信仰の放棄・・・これは拒否
　　　２.牧師職の剥奪
　　　３.宣教の禁止、信徒との交流禁止
　　　４.聖書の提出・・・すでに押収されているが拒否。
を申し渡された。

　当時はまだ３６歳の若い教師であったため、帰宅を許された。台湾部長であった古清水万太郎先生のみが拘留されたのである。
　基督教長老教会花蓮港教会の高端荘牧師は「何かお手伝いすることはありませんか」とかけつけて下さった。

　昭和１６年に教会の土地１４２坪２．５合を県庁より払い下げを受け、新会堂建築に向けて歩みだした矢先の弾圧による教会解散、牧師職剥奪、信徒との交流禁止であった。
　この時のことを手記には
【私は弾圧、教会解散の時、「この地の人々にどの様に受け止められたか」、「日頃、けんめいに努めた証しができておったかどうか」の恐れを持ちました。】
　　と書いている。

前掲書から引用し、当時の様子を描く。

[信徒との交流が断たれ、孤立無援の感であったが、主は慰めの手を延べられた。隣家の大石理蕃課長夫人をはじめ、隣組の各位、花蓮港長老教会高端荘牧師、役員有志、更に未知の方々の来訪。元警視古藤斉助氏の会社をはじめ　アルミ会社、２０有余の有力会社、事業所の就職勧誘の来訪を受け、７年３ヶ月の伝道生活の証しが立てられたことと主の憐みを感謝した。]

[６月１９日　台湾日々新聞花蓮港支局長加藤精一氏の夫人が来訪され、「役所の廊下で理蕃課長の大石さんが、『私は７年間小池さんの話を聞いていたが、悪い話は１度もなかった。あなたは聞いたことがあるのか』とM刑務課長に抗議されたことが裏目となり、“小池を苦しめてやれ”と立腹されたMさんが、各会社を廻り、小池は反国家的思想の持ち主で採用するとあなたの会社に迷惑がかかります、と妨害していますから、市内での就職は困難と思います。」というご主人からの言葉を伝えられた。]

[翌２０日M課長に面談を求めて、「ご存知のように私共には貯えがありません。花蓮港で再起したいと思いましたが就職ができませんので台南へ行こうと思います。台南におります友人小林喜美雄氏の紹介により、南日本製塩会社に社長の好意により採用が決定しております」と申し出た。要監視人である私の異動を好まないM課長は花蓮市警察熊谷署長に就職の相談をするように指示、熊谷署長は直ちに、同盟通信花蓮港支局長を訪ねなさいと指示され、高木局長に面接した。
　帰宅して間もなく熊谷署長より、花蓮港食糧管理組合を訪ねるように、との連絡を受け、直ちに出向。専務理事梅津三郎氏に面接した。
　初対面であったが、梅津専務理事は過年、運輸会社朝日組、古賀朝一郎氏夫人（教会員）の納棺式に列席、更に小野うら姉（教会員）よりの伝聞により、すべてを熟知されており、好意をもって空席の庶務主任として採用された。県内の全食糧の配給業務を行い、理事長高橋四与大六氏（陸軍主計中尉）、専務理事梅津氏（陸軍伍長）、主事田村武雄氏（陸軍軍曹）３氏は、刑事の来訪に際し、常に擁護下されたことを後日伝聞し感謝に溢れた。]

[６月２０日、就職も決定し、自分の語った福音の証人としての覚悟も新たに歩みが開始されたが、一週間後、晴天の霹靂、意外な展開に呆然となった。M課長の通達により、強制的に教会建物の明け渡し、指定家屋への転居、監視下におかれ、教会建物は刑務課分室として昭和２０年１０月まで使用された。このような扱いは花蓮港教会だけであった。]

　引用終わり。 （＜弾圧の中でも差しのべられた手：回想＞）